STUDI IN SILICO INTERAKSI MOLEKULER SENYAWA AKTIF PALA (Myristica Fragrans Houtt.) DENGAN CASPASE-1 SEBAGAI TARGET ANTI-INFLAMASI PADA JERAWAT

Angga Yasir

doi:10.36526/jc.v7i1.4991

Angga Yasir Institut Teknologi Sumatera

DOI: https://doi.org/10.36526/jc.v7i1.4991

Keywords: Myristica fragrans Houtt, molecular docking, caspase-1, acne, anti-inflammatory agent

Abstract

Jerawat merupakan kondisi dermatologis yang memerlukan penanganan efektif karena dapat mempengaruhi kualitas hidup penderita. Penelitian ini bertujuan untuk mengevaluasi interaksi molekuler senyawa aktif pala (Myristica fragrans Houtt.) dengan caspase-1 sebagai target anti-inflamasi pada jerawat menggunakan pendekatan in silico. Studi dilakukan menggunakan metode molecular docking terhadap metabolit utama pala meliputi miristisin, lignan, α-pinene, β-pinen, dan sabinen dengan protein target caspase-1 (PDB: 1BMQ). Hasil analisis menunjukkan bahwa lignan memiliki afinitas pengikatan tertinggi (-6.00 kcal/mol) dibandingkan dengan ligan alami (-5.00 kcal/mol). Analisis interaksi molekuler mengungkapkan bahwa lignan membentuk ikatan yang lebih kompleks meliputi ikatan hidrogen konvensional dengan HIS B:342 dan ARG B:383, interaksi π-anion dengan ASP B:381, π-cation dengan ARG B:352, serta interaksi π-sigma dan π-alkyl dengan VAL B:348 dan PHE B:377. Pola interaksi lignan berbeda dengan ligan alami yang didominasi oleh ikatan hidrogen dan interaksi elektrostatik. Hasil penelitian ini memberikan landasan ilmiah potensi senyawa pala, khususnya lignan, sebagai inhibitor caspase-1 yang dapat dikembangkan sebagai agen anti-inflamasi dalam pengobatan jerawat.

References

Aloliqi, A.A., 2024. Towards identification of therapeutics against multi-infections and cancers causing Propionibacterium acnes: Molecular modeling and dynamics simulation investigation. Journal of Molecular Liquids 415, 126373. https://doi.org/10.1016/j.molliq.2024.126373
Bouchouireb, Z., Olivier-Jimenez, D., Jaunet-Lahary, T., Thany, S.H., Le Questel, J.-Y., 2024. Navigating the complexities of docking tools with nicotinic receptors and acetylcholine binding proteins in the realm of neonicotinoids. Ecotoxicology and Environmental Safety 281, 116582. https://doi.org/10.1016/j.ecoenv.2024.116582
Brylinski, M., 2018. Aromatic interactions at the ligand-protein interface: Implications for the development of docking scoring functions. Chem Biol Drug Des 91, 380–390. https://doi.org/10.1111/cbdd.13084
Jang, W.Y., Kim, M.-Y., Cho, J.Y., 2022. Antioxidant, Anti-Inflammatory, Anti-Menopausal, and Anti-Cancer Effects of Lignans and Their Metabolites. Int J Mol Sci 23, 15482. https://doi.org/10.3390/ijms232415482
Morita, T., Jinno, K., Kawagishi, H., Arimoto, Y., Suganuma, H., Inakuma, T., Sugiyama, K., 2003. Hepatoprotective effect of myristicin from nutmeg (Myristica fragrans) on lipopolysaccharide/d-galactosamine-induced liver injury. Journal of agricultural and food chemistry 51, 1560–1565. https://doi.org/10.1021/JF020946N
Pratiwi, A., Noorlaela, E., Mahyuni, S., 2019. UJI DAYA HAMBAT SEDIAAN SABUN CAIR EKSTRAK DAUN PALA (Myristica fragrans houtt) TERHADAP Propionibacterium acnes dan Staphylococcus aureus. EKOLOGIA 19, 80–88. https://doi.org/10.33751/EKOL.V19I2.1649
Sandoval, A.G.W., Vaughn, L.T., Huang, J.T., Barbieri, J.S., 2023. Role of Tumor Necrosis Factor-α Inhibitors in the Treatment and Occurrence of Acne: A Systematic Review. JAMA dermatology 159. https://doi.org/10.1001/JAMADERMATOL.2023.0269
Setyawati, N.K.A.A., Santika, I.W.M., Yustiantara, P.S., 2022. Molecular Docking Senyawa α-mangostin sebagai Antiinflamasi secara In Silico. Jurnal Jejaring Matematika dan Sains 4, 41–49. https://doi.org/10.36873/jjms.2022.v4.i2.707
Trifan, A., Zengin, G., Korona-Glowniak, I., Skalicka-Woźniak, K., Luca, S.V., 2023. Essential Oils and Sustainability: In Vitro Bioactivity Screening of Myristica fragrans Houtt. Post-Distillation By-Products. Plants 12. https://doi.org/10.3390/PLANTS12091741
Vandana, L.P., Ramadoss, R., 2022. Extraction of natural myristic acid from nutmeg with expanded vermiculite for thermal energy storage. Journal of Energy Storage 52. https://doi.org/10.1016/J.EST.2022.104770
Yunita, M. (Melda), Manse, Y. (Yosephina), Wulandari, M.C. (Myllisa), Sukmawati, S. (Sukmawati), Ohiwal, M. (Morgan), 2022. Isolation of Endophytic Bacteria From Nutmeg Plant as Antibacterial Agents Against Pathogenic Bacteria. Jurnal Pendidikan Biologi 7, 115–122. https://doi.org/10.31932/JPBIO.V7I1.1522
Zhou, Y., Liu, Y.E., Cao, J., Zeng, G., Shen, C., Li, Y., Zhou, M., Chen, Y., Pu, W., Potters, L., Shi, E.Y., 2009. Vitexins, nature-derived lignan compounds, induce apoptosis and suppress tumor growth. Clin Cancer Res 15, 5161–5169. https://doi.org/10.1158/1078-0432.CCR-09-0661