ANALISA DOCKING SENYAWA MINYAK ATSIRI LENGKUAS (Alpinia galanga) TERHADAP BETA-LAKTAMASE MENUNJUKKAN POTENSI PENGIKATAN RENDAH

I Dewa Agung Panji Dwipayana

doi:10.36526/biosense.v9i1.7063

Authors

I Dewa Agung Panji Dwipayana Biology Department, Udayana University

DOI:

https://doi.org/10.36526/biosense.v9i1.7063

Keywords:

Lengkuas; minyak atsiri; β-laktamase; docking; resistensi antimikroba

Abstract

Resistensi antimikroba terhadap antibiotik β-laktam, khususnya yang dimediasi oleh enzim β-laktamase, menjadi tantangan serius dalam pengobatan infeksi bakteri. Lengkuas (Alpinia galanga) dikenal memiliki aktivitas antimikroba, namun potensi senyawa minyak atsirinya sebagai inhibitor β-laktamase belum banyak dievaluasi secara spesifik. Penelitian ini bertujuan untuk menilai potensi pengikatan senyawa minyak atsiri A. galanga terhadap enzim β-laktamase Staphylococcus aureus menggunakan pendekatan in silico. Struktur protein β-laktamase (PDB ID: 1GHP) dan beberapa senyawa utama minyak atsiri lengkuas dianalisis menggunakan metode molecular docking dengan AutoDock 4.2. Amoksisilin digunakan sebagai ligan pembanding. Hasil docking menunjukkan bahwa amoksisilin memiliki afinitas pengikatan tertinggi dengan energi ikat −6,60 kcal/mol, sedangkan seluruh senyawa minyak atsiri A. galanga menunjukkan energi ikat yang lebih lemah (−4,13 hingga −5,58 kcal/mol). Analisis interaksi molekuler memperlihatkan bahwa senyawa minyak atsiri membentuk interaksi hidrofobik dan ikatan hidrogen terbatas, yang secara umum kurang optimal untuk inhibisi enzimatik yang kuat. Temuan ini mengindikasikan bahwa senyawa minyak atsiri lengkuas memiliki potensi yang terbatas sebagai inhibitor β-laktamase, sehingga tidak dapat digunakan untuk mengatasi resistensi antibiotik akibat adnaya beta-laktamase.

References

Priyono, Qiara Amelia Putri, et al. "Ethnomedical potentials, phytochemicals, and medicinal profile of Alpinia galanga L.: a comprehensive review." BIO Integration 5.1 (2024): 982.

Tian, Yufeng, et al. "Antioxidant, antibacterial, enzyme inhibitory, and anticancer activities and chemical composition of Alpinia galanga flower essential oil." Pharmaceuticals 15.9 (2022): 1069.

Zhang, Song, et al. "Role of β-lactamase inhibitors as potentiators in antimicrobial chemotherapy targeting Gram-negative bacteria." Antibiotics 13.3 (2024): 260.

Dwipayana, I. D. A. P., et al. "Development of a dimer-based screening system for dimerization inhibitor of HIV-1 protease." J. Microbiol. Biotechnol 2 (2020): 1-11. DOI: 10.37604/jmsb.v2i1.42

Elabed, Seifeldin, et al. "Integrated experimental and computational analysis reveals amoxicillin binding dynamics to PBP1a in Staphylococcus aureus." Scientific Reports 15.1 (2025): 20284.

Aini, Diah Miftahul, et al. "In Silico Investigation Of Molecular Interactions Between Inulosucrase Derived From Aspergillus Awamori And Epe Compounds." Indonesian Journal of Pure and Applied Chemistry 8.2 (2025): 91-100.

Ma, Zhiwei, Abeeb Ajibade, and Xiaoqin Zou. "Docking strategies for predicting protein-ligand interactions and their application to structure-based drug design." Communications in information and systems 24.3 (2024): 199.